Organisasi ini didirikan oleh para alumni SMAN 3 Jakarta angkatan 1994 bersama alumni Universitas Trisakti. Mereka membawa semangat kebersamaan dan kolaborasi untuk menjadikan SPAI sebagai wadah yang memberikan banyak dampak terutama untuk pendidikan Al-Qur’an di Indonesia.
Sejak awal berdirinya SPAI telah mencetak 6.000 mushaf Al-Qur'an yang dibagikan kepada TPQ, para asatidz, teman-teman alumni SMAN 3 Jakarta dan Universitas Trisakti serta masyarakat di sekitar wilayah pendiri. Hingga tahun 2024, SPAI telah berhasil menyalurkan 84.000 mushaf Al-Qur'an ke berbagai pelosok negeri.
Selain itu, SPAI juga aktif memberikan bantuan kemanusiaan ke Gaza, Palestina, sejak November 2023, termasuk makanan darurat, air minum, tenda darurat, solar panel, pakaian hangat, program trauma healing, dan sekolah darurat untuk pengungsi di sana.
Hingga tahun 2024, SPAI telah menyalurkan dana sebanyak Rp 6.310.169.500 dengan penerima manfaat mencapai 800.000 orang. Wilayah cakupan SPAI meliputi 32 provinsi di Indonesia dan tiga negara di luar negeri, yaitu Somalia, Yordania, dan Palestina.